广西农科院是广西壮族自治区人民政府直辖的农业科研单位，主要从事以种植业为主的应用及应用基础研究，重点是粮、糖、果、菜、油、麻、食用菌、花卉等作物优良品种的选育及栽培，以及农产品加工、营养、植保、农业环境、农产品质量安全与检测等配套新技术研究。
广西农科院机关设有院办公室、人事处、科技处、计财处、后勤管理处、成果转化处、国际合作处、机关党委、监察室、科研基地管理处、离退处等11个处室；设有甘蔗研究所、玉米研究所（旱粮作物研究所）、水稻研究所、农业资源与环境研究所、园艺研究所、经济作物研究所、植物保护研究所、作物品种资源研究所、农业科技信息研究所、农业经济研究所、生物技术研究所、微生物研究所、蔬菜研究所、广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室、农产品加工研究所、葡萄与葡萄酒研究所、花卉研究所、农产品质量安全与检测技术研究所等18个科研机构。